Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB35Q15286 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms