Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms