Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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