Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms