Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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