Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms