Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms