Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms