Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLN3Q13286 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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