Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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