Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms