Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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