Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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