Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CSTF3Q12996 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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