Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF1Q12946 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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