Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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