Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms