Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLEQ07864 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms