Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms