Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.5 ms