Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CREMQ03060 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CREMQ03060 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms