Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms