Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms