Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms