Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms