Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms