Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms