Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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