Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms