Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK8P49336 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK8P49336 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK8P49336 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK8P49336 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK8P49336 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK8P49336 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms