Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms