Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms