Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG3P32926 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG3P32926 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG3P32926 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG3P32926 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG3P32926 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG3P32926 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG3P32926 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSG3P32926 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 LINC02246-207ENST00000630354 524 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AP000842.1-201ENST00000524467 698 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 TAS2R1-201ENST00000382492 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG3P32926 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms