Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms