Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms