Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT10P13645 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT10P13645 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT10P13645 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT10P13645 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT10P13645 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms