Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFTRP13569 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFTRP13569 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFTRP13569 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFTRP13569 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms