Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms