Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP2AP11388 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms