Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHGAP10645 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms