Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1O95273 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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