Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRATO95237 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRATO95237 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms