Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24DO94855 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24DO94855 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24DO94855 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24DO94855 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24DO94855 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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SEC24DO94855 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SEC24DO94855 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SEC24DO94855 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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