Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CXCL13O43927 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CXCL13O43927 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CXCL13O43927 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL13O43927 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CXCL13O43927 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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