Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms