Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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