Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLGNO14967 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLGNO14967 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms