Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E9PBE3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms