Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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C9orf172C9J069 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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C9orf172C9J069 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C9orf172C9J069 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf172C9J069 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf172C9J069 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf172C9J069 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf172C9J069 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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