Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVV-2B6SEH9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms